胚胎畸形率指在胚胎发育过程中，出现结构或功能异常的胚胎占总胚胎数的比例。它反映了胚胎发育的健康程度。比如在辅助生殖技术中，通过对一批胚胎进行观察评估，统计出畸形胚胎数量，进而得出畸形率。其受多种因素影响，像母体的年龄、孕期接触有害物质、遗传因素等。高胚胎畸形率可能导致流产、胎儿出生缺陷等不良后果，在临床和生殖研究领域备受关注，是衡量胚胎质量的重要指标。
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